教会既是上帝的家，也是基督的身体，是那充满万有者所充满的。教会的权柄当然是源于耶稣基督。基于基督权柄的超越性与临在性，教会的权柄必须是超过一切执政掌权、有形无形、天上地下的所有权力（参看腓2:9-11）。因这权柄是耶稣基督升天后，差遣圣灵保惠师自由运行在教会里，促使众圣徒都顺服在真理的约束之下而施行出来的。
上帝既然把基督复活得胜世界、死亡、魔鬼的权柄托付给教会和圣徒，目的就是要圣徒在教会里能依照圣灵的引导，根据圣经的教训，在确认上帝纯全、善良、可喜悦的旨意上，做好管理教会的工作，牧养信徒的灵性——做好教导的工作，拓展教会福音的事工——做好差传的工作，使世人因听闻真理、明白真理而归顺基督。
总而言之，教会的权柄应当隶属于上帝，本着上帝的旨意行使荣耀上帝的事务。
上帝赐给教会的权柄既是由圣灵直接施行的，那么，教会就当按照圣灵所赐下的各种恩赐来建造（参看林前12:4-11，28-31；弗4:11-16）。
从形式上看，凡是教会正式的会友都具有选举、接纳、惩戒、表决的权利。然而，在处理教会的常务或特殊事务时，却应当由那些通过教会信徒选举、确认生命里有神的恩膏和圣灵的恩赐的弟兄姐妹来执行。因为他们是上帝在教会中的代表（或称真理的共同权柄）（参看罗12:5-21；13:1-7）。
教会的权柄从原则上讲，牧师、传道、长老、执事应当在顺服圣灵的同时，凭着圣经的真理法则，施行指导、安慰、教训、劝勉、警戒、惩罚的权柄（参看太18:15-18；林前5:1-5；提后4:1-2；约叁9-11），以引导信徒在教会的属灵生活中，进入合乎真理的荣耀境界。
“所以，我不在你们那里的时候，把这话写给你们，好叫我见你们的时候，不用照主所给我的权柄，严厉的待你们，这权柄原是为造就人，并不是为败坏人”（林后13:10）
